Фамилия Дудукина — классический пример русской «патронимической» фамилии, образованной от прозвища или нецерковного имени с помощью суффикса принадлежности -ин. Модель простая: Дудука → сын Дудуки → Дудукин → Дудукина (форма жены или дочери). Суффикс -ин, а не -ов, указывает на то, что основа прозвища оканчивалась на -а или -я.

Самая прямая и убедительная версия связывает основу «Дудука» со старинным названием духового музыкального инструмента — дуда. На дуде, простой пастушьей трубе, играли повсеместно. Отсюда логично выводится и род занятий предка: он мог быть пастухом, дудочником-музыкантом или, что не менее вероятно, мастером, изготавливавшим дудки из подручных материалов — бузинной трости, камыша, тростника или ивовой коры, снятой ранней весной. Прозвище Дудука в этом случае закрепилось бы за человеком, чья связь с дудой была очевидна для окружающих.

Впрочем, у лингвистов есть и второй вариант, основанный на диалектном значении глагола «дудить». В ряде русских говоров «дудить» означало не играть на дудке, а пить много и жадно, без передышки (чаще о воде или квасе). Прозвище Дудука, данное любителю так пить, перешло бы на его потомков по той же модели. Обе версии — «музыкальная» и «поведенческая» — имеют под собой реальную языковую почву, и обе в равной степени возможны.

Менее вероятна, хотя и любопытна, гипотеза, связывающая фамилию с армянским дудуком. Армянский дудук, изготовляемый из абрикосового дерева, — инструмент с совершенно иной культурной и географической привязкой. Для русского прозвища, возникшего в крестьянской или посадской среде, такое заимствование маловероятно. Скорее всего, сходство звучания здесь случайно, и основу фамилии всё же дала славянская «дуда».

Фамилия Дудукина встречается в основном в центральных и южных регионах России, что косвенно подтверждает её исконно русское происхождение и связь с пастушеским или ремесленным бытом. Какой бы из двух основных версий ни отдать предпочтение, ясно одно: фамилия эта — не книжная и не искусственная, а живая, прозвищная, родившаяся в народной среде.