Фамилия Душенькина — женская форма, мужской вариант — Душенькин. Она относится к числу фамилий, образованных от личных имён или прозвищ с помощью суффикса -ин, который указывает на принадлежность: «чей?» — Душенькин, то есть сын или потомок Душеньки.

Основа фамилии — слово «душенька». В русском языке это ласкательная форма от «душа»: так называли милого, любимого человека, нередко ребёнка. В словаре В. И. Даля «душенька» — это обращение к близкому, а также уменьшительное от имени Душа, которое в старину могло быть самостоятельным нецерковным именем. Таким образом, первым носителем прозвища Душенька мог быть ласковый, душевный человек или, наоборот, тот, кого так называли в семье — например, младший сын или дочка.

Не стоит путать с фамилией Душенкин, которая может восходить к диалектному слову «душень» (от «душить») или к глаголу «душить». В случае с Душенькиным корень однозначно ласковый, без агрессивных коннотаций.

Географически фамилия встречается в центральных регионах России, особенно в бывших Рязанской, Тамбовской и Владимирской губерниях. По данным переписей XIX века, Душенькины — преимущественно крестьяне и мещане. Дворянских родов с этой фамилией в «Бархатной книге» и других родословных сборниках не зафиксировано, что типично для фамилий, образованных от народных прозвищ.

Интересная деталь: в некоторых говорах «душенька» могло быть не только обращением, но и названием особого сорта пряников или обрядового печенья, которое дарили на помин души. Если предок был пекарем или торговал сладостями, прозвище могло закрепиться и по этому признаку. Однако основная версия — от личного ласкового прозвища — остаётся самой простой и правдоподобной.