Фамилия Дынников образована от прозвища Дынник — так в старину называли бахчу, место, где растут дыни. Скорее всего, прозвище закрепилось за человеком, который выращивал дыни, то есть указывало на его занятие. Но возможен и другой бытовой повод: Дынником могли прозвать любителя дынь, охочего до этого лакомства.

Здесь стоит обратить внимание на суффикс -ник, типичный для названий мест (малинник, вишнёвник) и для обозначения человека по его пристрастию или занятию (охотник, работник). Прозвище Дынник — из того же ряда. Фамилия образована по стандартной русской модели: к основе Дынник добавили притяжательный суффикс -ов, означающий «чей?» — то есть «сын Дынника».

Есть и другая, менее очевидная версия. В северных говорах дынником называли пшенную кашу с тыквой, сваренную на молоке. В этом случае прозвище могло относиться к любителю такого блюда или к тому, кто его хорошо готовил. Более того, не исключено, что Дынник — это старинное нецерковное имя, данное по названию кушанья, что встречалось в языческой традиции. Однако первая версия, с профессиональным именованием, выглядит правдоподобнее: фамилии, указывающие на род деятельности предка, встречаются гораздо чаще, чем прозвища от названий каш. Потомок человека с прозвищем Дынник со временем и получил фамилию Дынников.