Фамилия Дынникова образована от прозвища Дынник, которое восходит к аналогичному нарицательному. Дынником в старину называли место, где растут дыни, или же любителя дынь. Таким образом, можно предположить, что прозвище Дынник относится к профессиональным именованиям, то есть указывает на род деятельности предка (он мог заниматься выращиванием бахчевых растений). Возможно и то, что Дынником прозвали человека, охочего до дынь. По другой версии, в основе фамилии Дынникова лежит не прозвище, а старинное языческое имя Дынник, данное по названию кушанья. Так, на Севере дынником называется пшенная каша с тыквой, приготовленная на молоке. К подобным именам может относиться и имя Дынник. Однако нельзя исключать, что Дынником прозвали любителя не дынь, а такой каши, или же того, кто хорошо готовил дынник. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Дынник, со временем получил фамилию Дынникова.