Фамилия Дюбакина хранит память о прозвище дальнего предка — Дюбака. Слово это неоднозначное, и у него есть как минимум два объяснения.

Первая версия отсылает к курскому говору, где глагол «дюбать» означал «клевать» (о птицах). Отсюда прозвище Дюбака могли дать птицеводу, который разводил кур и гусей, либо, напротив, человеку, который ел очень мало, буквально «клевал» еду, как птичка.

Вторая гипотеза связывает прозвище с прилагательным «дюбаный» — то есть «рябой», пестрый. В этом случае Дюбакой называли либо любителя яркой, броской одежды, либо человека с лицом, густо усыпанным веснушками. Оба значения — и «птицевод», и «рябой» — вполне могли бытовать в крестьянской среде, где прозвища часто давали по внешности или занятию.

Фамилия образована по стандартной русской модели: к основе Дюбак- добавился суффикс -ин, указывающий на принадлежность («чей?» — «сын Дюбаки»). Такая модель типична для северных и центральных областей России, где фамилии на -ин так же распространены, как на -ов. Фамилия Дюбакина — женская форма, мужская соответственно — Дюбакин.

Слово «дюбака» не встречается в современных словарях как нарицательное, что подтверждает его узкую диалектную природу. Вероятнее всего, прозвище родилось в одном из южнорусских или среднерусских говоров, где глагол «дюбать» ещё помнили, а затем закрепилось в качестве родового имени.