Фамилия Джанкараев образована от персидско-тюркско-татарского имени Джанкара. Оно имеет занчение «пусть родится душа». Вероятно, родители назвали Джанкарой долгожданного или позднего ребенка. Возможно также, что фамилия Джанкараев происходит от имени Джанкарай, состоящего из двух частей» «джан» и «карай». Первая из них берет начало от персидского нарицательного «джан» со значением «душа». Вторая часть имени Джанкарай восходит к мужскому имени Карай, которое в переводе с древнетюркского означает «стань грозным, сильным, мощным». Таким образом, именование Джанкарай можно трактовать как «тот, кто имеет сильную душу». Таким образом, потомок человека, которого звали Джанкара, со временем получил фамилию Джанкараев. Так, в источниках казахского происхождения упоминается Кундузбай Джанкараев, родившийся в 1868 году в Чуренском Алакульского района Алматинской области.