Фамилия Джапаров произошла от личного мужского имени Джапар — диалектного варианта арабского имени Джафар, которое переводится как «райский ручей». Это имя нередко употребляется в произведениях на арабском классическом языке. Имя Джафар используется также большинством иранских и тюркских народов, исповедующих ислам.