Фамилия Дзюбота — нечастая, и её разбор требует внимания к корню. В основе лежит слово «дзюба» или «дзуба», которое в южнорусских и украинских говорах означало «губа» или, реже, «рот», особенно если речь шла о толстой, отвислой или вывернутой губе. Суффикс «-ота» в фамилиях обычно указывает на качество или состояние: «дзюбота» — буквально «губастость», то есть человек с заметной, выделяющейся губой. Это типичная модель для прозвищ по внешнему признаку, как, скажем, Губатый или Губин, но с другим суффиксом.

Можно спорить, от какого именно слова пошла фамилия — «дзюба» (губа) или «дзуба» (вариант того же корня в белорусских и смоленских говорах). Оба варианта ведут к одному прозвищу. Иногда «дзюбой» называли человека с большим ртом или того, кто любит поговорить, но первичное значение — всё же физическая особенность. Фамилия редкая, поэтому её носители, скорее всего, сосредоточены в зоне распространения южнорусских и украинских говоров — на юге России, в Черноземье, на востоке Украины.

Словообразовательная модель — суффикс «-ота», который образует существительные со значением качества (ср. «доброта», «краснота»). Здесь он застыл в фамилии, превратившись из прозвища в родовое имя. Фамилия не получила типичного суффикса «-ов» или «-ин», потому что прозвище Дзюбота уже звучало как самостоятельное слово, и его не переделывали — просто закрепили в форме притяжательного прилагательного? Нет, это не притяжательное, а чистое прозвище в именительном падеже, что для русских фамилий редкость (чаще встречается у украинских и польских фамилий, например, Неборак, Непийвода). Поэтому Дзюбота — фамилия без суффикса, прямо указывающая на качество предка.

Сравните с однокоренными: Дзюба, Дзюбин, Дзюбанов. Дзюбота стоит особняком — она длиннее, с ударением на второй слог (Дзюбо́та), что тоже необычно. В документах могли писать и «Дзюбота», и «Дзубота», но вариант с «зю» более распространён. Если искать социальный контекст, то прозвища по внешности давали людям любого сословия, но чаще — крестьянам и казакам, у которых фамилии складывались из прозвищ. Никаких дворянских корней у Дзюботы нет — это фамилия простого человека, которого когда-то прозвали за приметную губу.