Фамилия Дзюбо звучит не по-русски, и это верная зацепка: её корни — в украинском и белорусском языках, а географически она плотнее всего привязана к западу и центру Украины, югу Беларуси и приграничным областям России. В отличие от типичных русских фамилий на -ов или -ин, Дзюбо застыла в «чистой» основе, без суффикса принадлежности, что характерно для украинской и польской моделей фамилий-прозвищ. Ударение почти всегда падает на первый слог: Дзю́бо.

Основа фамилии — слово «дзюба». В украинских говорах так называли человека с рябым лицом, то есть со следами оспы. «Дзюба» — то же, что и «рябой», «щербатый». Слово родственно древнерусскому «дзубати» — клевать, долбить, откуда и пошёл образ: лицо, будто поклёванное птицами. Таким образом, прозвище Дзюба давали человеку с заметным кожным дефектом, и оно, как и многие «отметины» (Кривой, Шепель, Хромой), со временем закрепилось в качестве фамилии. Форма Дзюбо — это, скорее всего, украинская падежная форма именительного падежа, характерная для ряда прозвищ (например, Литвин — Литвино, Голуб — Голубо), или же результат фонетического перехода «а» в «о» в некоторых говорах.

Встречается и версия о связи с польским «dziób» — «клюв», но она менее убедительна: польское слово дало бы фамилию Дзюб или Дзюбек, а не Дзюбо. Украинская версия с рябостью и оспой подкрепляется и тем, что в старых переписях можно найти параллельные варианты: Дзюба, Дзюбенко, Дзюбак — все они от одного корня. Носители фамилии Дзюбо — это потомки казаков, крестьян или мещан, получивших своё прозвище по внешнему признаку, и фамилия эта, в отличие от дворянских, не связана с землевладением или титулом, а вышла из народной, бытовой среды.