Фамилия Егишян имеет армянское происхождение. В основе лежит личное имя Егиш, которое переводится как «жаждущий могущества». Это имя носил армянский историк V века, описавший один из драматических периодов истории Армении — войну с персами. Его сочинение «О Вардане и войне армянской» охватывает 35-летнюю историю страны со времени падения династии Аршакидов до 464–465 годов и было создано во второй половине V века по просьбе полководца Давида Мамиконяна. Эта война известна в исторической литературе как «война Вардананц».

Фамилия образована с помощью типичного армянского суффикса -ян, который в диалектах может принимать форму -янц. В армянской ономастике такие форманты (включая -ян) первоначально означали «из семьи таких-то» или «из рода таких-то». Соответственно, фамилия Егишян поначалу имела значение «из рода Егиш». Это типичная модель для армянских фамилий, где основа — личное имя или прозвище родоначальника, а суффикс указывает на принадлежность к его потомкам.

В отличие от русских фамилий, где суффиксы -ов/-ев, -ин привязывают род к конкретному лицу, армянский -ян универсален и не меняется в зависимости от окончания основы. Поэтому фамилия Егишян не имеет вариантов вроде «Егишев» — она сохраняет исконную форму даже при русификации.

Поскольку процесс формирования фамилий был длительным, окончательно говорить о точном месте и времени возникновения рода Егиш можно лишь на основании глубоких генеалогических исследований. Однако ясно, что фамилия восходит к имени, которое носил исторический персонаж, оставивший след в армянской литературе и истории.