Фамилия Еллизарьева — один из тех редких случаев, когда написание говорит о происхождении больше, чем звучание. Двойная «л» и окончание «-ева» сразу выдают, что это не случайная описка, а книжная, церковная форма. В основе фамилии лежит каноническое имя Елисей (древнееврейское Элиша́ — «Бог — спасение»), но не в обиходной, а в грецизированной передаче. В греческом оригинале имя звучало как Ελισσαίος, и при переводе церковных текстов на церковнославянский первую букву «эпсилон» часто передавали через «Е», а двойное «сси» — через удвоенную согласную. Так получилась форма Еллисей, от которой через притяжательное прилагательное (чей? — Еллизарьев) образовалась фамилия. Тот же корень мы видим в более распространённых фамилиях Елисеев, Елисеенко, Елисеичев, но Еллизарьева стоит особняком — она сохранила архаичное написание, характерное для духовного сословия.

Судя по суффиксу «-ев», фамилия принадлежит к типичной русской модели «сын такого-то», но с одной оговоркой. В XVIII–XIX веках в среде семинаристов и священников было принято «облагораживать» фамилии, приближая их к греческим или латинским оригиналам. Священник Елисеев мог записать своих детей как Еллисеевские или Еллизарьевы, чтобы подчеркнуть книжное происхождение имени. Поэтому географически фамилия Еллизарьева чаще всего встречается в регионах с сильным влиянием церковных школ — в центральных губерниях России, а также на севере, где старообрядческая и синодальная традиции долго сохраняли архаичные формы.

Сама по себе фамилия редкая. Её носительницы (женская форма) могли происходить из семей потомственных священнослужителей или, реже, из купечества, которое тоже любило «учёные» фамилии. В отличие от крестьянских Елисеевых, где имя давали в бытовой форме, Еллизарьева — это маркер грамотности и определённого социального круга. Интересно, что двойная «л» со временем могла упрощаться в устной речи, но в документах её старались сохранять, поэтому сегодняшние носители фамилии могут столкнуться с тем, что их путают с Елизаровыми (от имени Елизар) — это разные корни, и путаница возникает именно из-за редкого написания.