Фамилия Емельянченко — яркий представитель украинской модели образования фамилий. Она построена по типичной для южнорусских и украинских земель схеме: к основе, в роли которой выступает имя или прозвище, добавляется суффикс -енк(о), означающий «маленький», «сын» или «потомок». То есть Емельянченко — это буквально «сын Емельяна» или «потомок Емельяна».

В основе фамилии лежит крестильное имя Емельян (от греческого «Аймилианос» — «ласковый», «приветливый»). В народной среде это имя было распространено очень широко, давая начало десяткам производных форм: Емеля, Емелька, Емельянец, Емельянищев. Фамилия Емельянченко образована от полной формы имени — Емельян, что указывает на уважительное отношение к предку. В отличие от фамилий, возникших из обиходных прозвищ (вроде Емелин или Емельянов), форма с суффиксом -енко в украинской традиции часто закреплялась за детьми или внуками человека, которого в селе знали именно по полному имени.

С географической точки зрения фамилия Емельянченко тяготеет к левобережной Украине и югу России. Наибольшая плотность носителей исторически фиксируется в Черниговской, Полтавской и Харьковской губерниях, а также на Кубани, куда фамилия попала с переселенцами в XVIII–XIX веках. Примечательно, что в документах XVII–XVIII веков встречаются варианты написания через «и» — Емельянченко, а также с удвоенной «н» — Емельяненко, что связано с местными диалектными особенностями произношения.

Род занятий предков-Емельянченко мог быть любым: имя Емельян носили и крестьяне, и казаки, и мещане. Никакой сословной привязки у этой фамилии нет — она массово бытовала в среде вольных и крепостных хлеборобов, а также среди реестрового казачества. В ревизских сказках XIX века Емельянченко часто фигурируют как «малороссияне», то есть государственные крестьяне или казаки, что отличает их от помещичьих крестьян центральной России.

Ономасты (например, Б. Унбегаун в своей работе «Русские фамилии») относят фамилии на -енко к древнейшему пласту украинской антропонимии, который окончательно сложился уже к XVI–XVII векам. Емельянченко — одна из тех фамилий, которые не требуют сложной реконструкции: её история прозрачна и укладывается в простую формулу «чей?» — «Емельянов сын».