Мужское крестильное имя Емельян (Емелиан) переводится с греческого как «льстивый», по другой версии оно происходит из латинского языка, где означает «соперник, участник соревнований». В основу фамилии легла производная форма имени — Емельяша. Вероятно, основатель рода Емельяшенковых был выходцем из рабочей или крестьянской среды. Со временем, вероятно, род Емельяшенко переехал в Россию, где и произошла русификация фамилии путем добавления суффикса -ов. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Емельяша, со временем получил фамилию Емельяшенкова.