Фамилия Емешин — один из примеров, где суффикс -ин указывает на происхождение от личного имени или прозвища, отвечая на вопрос «чей?». Основа здесь — Емеша. Это уменьшительная или обиходная форма от крестильного имени Емельян (каноническая форма — Емилиан, от латинского «соперник»). В русской народной среде имя Емельян сокращали до Емеля, Емеша, Емешка — так же, как от Иван делали Иваша. Именно от формы Емеша и возникла фамилия: Емешин буквально означал «сын Емеши» или «человек из рода Емеши».

Версия с другим корнем существует, но она менее вероятна. В некоторых говорах «емеша» могли называть суетливого или надоедливого человека — от глагола «емешить» (суетиться, докучать). Но даже в этом случае фамилия образовалась бы по той же модели: прозвище Емеша плюс суффикс -ин. Различить, легло ли в основу имя или прозвище, сейчас почти невозможно — оба варианта вели к одному результату.

Географически фамилия Емешин привязана к северным и центральным регионам России, особенно к Архангельской и Вологодской областям. В этих краях имя Емельян было очень популярно, а суффикс -ин типичен для фамилий севернорусского типа (в отличие от южнорусских на -ов). Встречается она и в Поволжье, но реже.

Любопытная деталь: в дореволюционных переписях Емешины часто записывались как крестьяне или мещане. Фамилия не получила дворянского распространения, поэтому её носители — преимущественно потомки сельских жителей, где имя Емельян передавалось из поколения в поколение. Сравните с однокоренными фамилиями: Емельянов — более распространённая и «официальная» форма от полного имени, а Емешин — именно народный, «домашний» вариант, сохранивший разговорное звучание.