Фамилия Емиков образована по одной из самых распространённых в русском языке моделей: от личного имени или прозвища с помощью суффикса -ов. Здесь основа — Емик, а суффикс указывает на принадлежность: «сын Емика» или «из рода Емиковых». Чтобы понять корень, нужно разобраться, что такое «Емик».

Скорее всего, Емик — это уменьшительно-ласкательная форма крестильного имени Емельян (от греческого «ласковый, льстивый»), реже — Еремей (от древнееврейского «бог возвысит»). Усечение и добавление суффикса -ик в народной речи давало множество обиходных вариантов: Емеля, Ема, Емик. Такой способ словообразования типичен для XVI–XVII веков, когда фамилии только закреплялись. Подтверждение этому — фамилия Емельянов, которая стоит в том же гнезде, но образована от полной формы, а Емиков — от более короткой, бытовой.

Вторая версия, менее вероятная, но возможная: прозвище Емик могло быть связано с глаголом «емлить» (брать, хватать) в значении «хваткий, цепкий человек». Однако для прозвищ с таким корнем чаще использовали форму Емля или Ема, а Емик тяготеет к именной, а не глагольной основе.

Географически фамилия редкая. Основные следы ведут в центральные и южные регионы России: Курская, Воронежская, Ростовская области. Встречается она и среди донских казаков, где нередко фиксировались фамилии от уменьшительных форм имен. В ревизских сказках XVIII века можно найти Емиковых среди однодворцев — государственных крестьян, которые когда-то несли сторожевую службу на южных рубежах.

В написании фамилии возможна путаница с Ёмиков — от имени Ёма (просторечная форма от Иоанн). Но в документах, как правило, стоит именно «Емиков», что подтверждает связь с Емельяном или Еремеем.