Фамилия Емльянов — один из тех редких случаев, когда написание «съело» букву, но не изменило смысла. Перед нами вариант фамилии Емельянов, где вместо привычного «е» после «м» стоит «ь». В дореволюционной орфографии и в народных говорах такое «смягчение» или беглая запись встречалась: Емльянов, Емьянов, Емельянов — всё это звенья одной цепи. Основа фамилии — крестильное мужское имя Емельян (церковная форма Емилиан, от латинского Aemilianus — «принадлежащий к роду Эмилиев»). Суффикс -ов указывает на типичную русскую модель «чей сын?»: Емльян → Емльянов, то есть потомок человека по имени Емельян.

Если отбросить орфографическую загадку, происхождение фамилии типично для центральной России и Поволжья. Имя Емельян было очень распространено среди крестьян и мещан в XVII–XIX веках, поэтому и фамилия встречается часто. Носители Емльяновы в старых метрических книгах — это, как правило, государственные крестьяне, реже — однодворцы (особенно в Тамбовской, Рязанской, Воронежской губерниях). Написание с «ь» могло закрепиться в документах из-за местного произношения: в некоторых говорах имя звучало как [йимльян] с выпадением гласного, и писарь фиксировал его на слух.

Интересно, что при переписях и паспортизации в советское время часть Емльяновых «исправили» фамилию на Емельяновы, посчитав первый вариант ошибкой. Но те, кто сохранил редкую форму, несут в ней отпечаток конкретного говора и канцелярской традиции своего региона. Сейчас Емльяновы встречаются реже, чем Емельяновы, и это хороший маркер для генеалогического поиска: если в архивах ваши предки записаны как Емльяновы, скорее всего, они жили на территории, где в XIX веке было распространено аканье и редукция гласных в быстрой речи.

Никакой другой смысловой нагрузки, кроме отчества, фамилия не несёт. Ни прозвища, ни профессии за ней не стоит — только имя, которое когда-то дали при крещении.