Фамилия Емошкин — одна из тех, где за простым звучанием скрывается неочевидная основа. В отличие от большинства русских фамилий на -ин, образованных от имён на -а/-я (Иван → Иванов, но Ивашка → Ивашкин), здесь корень не от полного церковного имени, а от разговорной или прозвищной формы.

Самый вероятный источник — имя Емошка. Это уменьшительная форма от Емельян (каноническое Емилиан) или, реже, от Ермолай. В русской народной традиции Емельян превращался в Емелю, Емошку, Емоху. Суффикс -к- (Емошка) типичен для обиходных имён XVI–XVII веков: так называли в крестьянской и посадской среде. Фамилия Емошкин, таким образом, означает «сын Емошки», то есть потомок человека, которого в быту звали Емошкой.

Версия с прозвищем маловероятна, но не исключена. В диалектах слово «емошить» могло означать «суетиться, хлопотать» или «теребить, трепать». Если прозвище Емошка закрепилось за беспокойным или суетливым человеком, фамилия пошла бы от него. Однако ономасты чаще связывают подобные фамилии с крестильными именами, так как суффикс -ин здесь стандартен для патронимов, а не для прозвищ.

Географически фамилия встречается рассеянно, без ярко выраженного гнезда, что типично для фамилий, образованных от не слишком распространённых форм. Есть записи в Поволжье и центральных областях России. Интересно, что в некоторых переписях XIX века фигурирует вариант Емашкин — с тем же корнем, но через «а», что отражает акающее произношение.

Таким образом, Емошкин — это фамилия, которая прямо говорит о предке по имени Емошка, скорее всего Емельяне или Ермолае. Она не редкая, но и не массовая, и её разбор показывает, как от простонародного уменьшительного имени рождалась устойчивая родовая фамилия.