Фамилия Ермошкин образована от имени Ермошка — это не самостоятельное имя, а уменьшительная форма от целого ряда крестильных имён, начинающихся на Ерм-: Ермолай, Еремей, Ермил, Ерм, Ермий. Самое известное из них — Ермолай, которое в переводе с греческого означает «вестник народа». Покровителем этого имени считается священномученик Ермолай, казнённый за проповедь христианства в IV веке; его память в православии приходится на 8 августа. Однако Ермошка мог быть и производным от Еремея («дающий богатство»), Ермила («из гермесова леса») или даже от имени самого Гермеса (Ерм, Ермий). В быту все эти редкие имена сокращали до единого ласкового варианта — Ермошка, который и закрепился в фамилии.

Суффикс -ин указывает на принадлежность: потомок человека по имени Ермошка получал прозвание Ермошкин, то есть «сын Ермошки». Такая модель типична для русских фамилий, образованных от имён на -а, -я. Фамилия встречается преимущественно в центральных и поволжских регионах России, где имя Ермолай было особенно популярно в крестьянской среде. Встречаются и однокоренные фамилии — Ермолаев, Ермохин, Ермилов, но Ермошкин стоит особняком: в ней не основа, а именно уменьшительная форма, которая могла закрепиться как мирское имя, вытеснив полное крестильное.