Фамилия Енакиев — один из примеров того, как церковное имя, пройдя через цепочку народных сокращений, закрепилось в родовом прозвании. В её основе лежит крестильное имя Иоанникий, которое пришло из греческого языка и восходит к слову «никэ» — победа. Полная форма имени была длинной и труднопроизносимой для повседневной речи, поэтому в быту оно сокращалось: сначала до Аникий, затем до Енакий. Именно от этого варианта — Енакий — и образована фамилия с помощью патронимического суффикса -ев, означающего «сын Енакия» или «потомок Енакия».

Модель образования здесь типична для русских фамилий второй половины — конца XIX века: к основе, которая была просторечной формой имени, добавлялся суффикс принадлежности. Интересно, что суффикс -ев, а не -ов, указывает на то, что основа оканчивалась на мягкий согласный (в имени Енакий конечный звук был мягким, что и определило написание).

В истории известен дворянский род Енакиевых, что говорит о социальном статусе носителей фамилии. Самый яркий его представитель — Фёдор Егорович Енакиев (1852–1915), предприниматель и крупный донецкий промышленник. Его деятельность была связана с развитием угольной и металлургической промышленности Донбасса, и именно его именем назван город Енакиево. Таким образом, фамилия Енакиев не просто указывает на происхождение от предка по имени Енакий, но и имеет конкретную географическую привязку к региону, где потомки этого рода оставили заметный след.