Фамилия Ендина ведет свое начало от прозвища Енда. В архангельских говорах так называли свободолюбивую женщину. Согласно другой гипотезе, в основе фамилии Ендина лежит нарицательное «ёндина» или «ёндыль» - «ремень в оленьей упряжке». Некоторые исследователи полагают, что это слово восходит к ненецкому «ё иня», то есть «ремень, который в упряжи проходит посередине туловища оленя». Исходя из этого, можно предположить, что основатель рода Ендиных занимался изготовлением таких ремней. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Енда, со временем получил фамилию Ендина.