Фамилия Ентин — один из тех случаев, где основа настолько короткая, что сразу вызывает вопросы. В ней всего четыре буквы, и это не усечённая версия длинной фамилии, а самостоятельная модель.

Словообразовательно фамилия прозрачна: суффикс -ин указывает на принадлежность («чей?»), а корень — Ент-. В русских фамилиях такой корень встречается редко, и почти всегда он восходит к личному имени или прозвищу через тюркское или финно-угорское посредство. Самая вероятная версия — от тюркского имени Йенте (или Енте), которое в некоторых диалектах означало «младший», «меньшой». В татарской и башкирской среде такое имя давали младшему сыну, чтобы отличать его от старших братьев. Соответственно, Ентин — буквально «сын или потомок Енты».

Есть и другая, менее распространённая версия: связь с еврейским именем Йоханан через его уменьшительную форму Ента. В этом случае фамилия могла возникнуть в среде ашкеназских евреев на территории черты оседлости. Однако для еврейских фамилий характерен суффикс -ин в белорусском и украинском регионах, и там она чаще писалась бы как Ентин, но с ударением на первый слог. У русских Ентиных ударение обычно на второй слог — ЕнтИн, что сближает её с тюркской моделью.

Географически фамилия не массовая. Основные очаги — Поволжье (особенно Татарстан, Башкирия, Самарская область) и Центральная Россия. Это косвенно подтверждает тюркскую версию: именно в этих местах происходило смешение русского и тюркского населения, и фамилии на -ин от тюркских имён — обычное дело.

В дореволюционных источниках фамилия фиксируется поздно, в основном с XIX века. Это говорит о том, что она сформировалась не в боярской или дворянской среде, а среди крестьян и мещан. Фамилия не получила широкого распространения и осталась редкой — её носителей в России насчитывается не более нескольких тысяч человек.