Фамилия Еньков образована от имени Еня — уменьшительной формы крестильного имени Евгений (с греческого — «благородный»). В основе лежит народная, обиходная версия имени, которая в быту вытесняла полную церковную форму. Именно от неё, через цепочку «Евгений → Еня → Енько → Еньков», и пошла фамилия.

Ключевая деталь — суффикс -ко. В украинской традиции он типичен для фамилий, образованных от личных имён и прозвищ (Енько, Иванько, Петько). Фамилия Еньков — это русифицированный вариант украинской фамилии Енько: русское окончание -ов заменило украинское -ко, когда носитель фамилии оказался в великорусской среде. Такая адаптация — частое явление для выходцев с Украины и южнорусских земель.

Покровителем имени Евгений считается священномученик Евгений Херсонесский. Он проповедовал христианство в Северном Причерноморье — от Дуная до Днепра, включая Крым, и принял мученическую смерть в IV веке в Херсонесе Таврическом. Эта связь придаёт фамилии не только бытовое, но и церковно-историческое измерение: имя, от которого она произошло, носил реальный проповедник, чтившийся на южных рубежах Руси.

Таким образом, фамилия Еньков — не просто производное от имени Евгений, а конкретный образец украинско-русского пограничья: уменьшительная форма, суффикс южнорусского типа и последующая русификация. Потомок человека по имени Еня со временем и получил фамилию Еньков.