Фамилия Еньков образована от имени собственного и относится к распространенному типу русских фамилий. Основой фамилии Еньков послужило имя Еня. Фамилия Еньков восходит к мужскому крестильному имени Евгений, которое в переводе с греческогоязыка означает «благородный». Поэтому и в основу фамилии Еньков легла одна из уменьшительных форм имени Евгений – Еня. Суффикс –ко указывает на то, что фамилия Еньков является русифицированным вариантом украинской фамилии Енько. Покровителем человека с именем Евгений считался священномученик Евгений, который проповедовал христианство в землях Северного Причерноморья от Дуная до Днепра, включая Крым, и принял мученическую смерть в IV веке в городе Херсонесе Таврическом. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Еня, со временем получил фамилию Еньков. О точном месте и времени возникновения фамилии Еньков в настоящее время говорить сложно, поскольку процесс формирования фамилий был достаточно длительным. Тем не менее, фамилия Еньков представляет собой замечательный памятник славянской письменности и культуры.