Фамилия Епонишникова образована от прозвища Епонишник. Оно восходит к существительному «епанча», то есть «широкий безрукавный плащ». Вероятно, именование Епонишник указывает на род деятельности его обладателя. Так могли прозвать того, кто занимался пошивом этого вида одежды. Кроме того, на плавильных заводах епанчой называли печной кожух. Поэтому можно предположить, что прозвище Епонишник получил кочегар, либо рабочий-металлург. Не исключено также, что фамилия Епонишникова образована от имени Епонишник, которое восходит к существительному «епанечник». Так в старину называют растение «копытень». Оно издавна использовалось в народной медицине и ветеринарии. Давая младенцу такое имя, как Епонишник, родители хотели, чтобы природа воспринимала ребёнка как своего, чтобы к нему перешли те полезные качества, которыми наделено это животное. Так и прозвище Епонишник закрепилось за человеком в качестве наиболее употребительного именования, а со временем легло в основу фамилии Епонишников. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Епонишник, со временем получил фамилию Епонишников.