Фамилия Епанишникова — женская форма фамилии Епанишников, которая образована от названия профессии. В основе лежит слово «епанишник» — так в старину называли мастера, который шил епанчи.

Епанча — это старинная верхняя одежда, широкий плащ без рукавов или с очень короткими рукавами. Епанчи носили и в будни, и в праздники, а на Руси они были известны с домонгольского времени. Значит, предок носительницы этой фамилии был портным, специализировавшимся на изготовлении именно этого вида одежды.

Модель образования типична для русских фамилий: суффикс -ник- указывает на лицо по роду занятий (ср. сапожник, печник, плотник), а затем к основе «Епанишников» добавился суффикс -а, указывающий на принадлежность женщине — жене или дочери Епанишникова. Такая схема (профессия + -ов/-ев, затем -а) — одна из самых распространённых в русском ономастиконе.

Сама фамилия встречается нечасто и имеет выраженную географическую привязку. Основной ареал — северные и северо-восточные области России: Архангельская, Вологодская, Кировская области, а также Урал и Сибирь. В этих регионах в XVI–XVII веках ремесленники часто получали прозвища по изделию, которое делали, и эти прозвища закреплялись как фамилии.

Слово «епанишник» зафиксировано в словарях русского языка (например, в «Толковом словаре» В. И. Даля), хотя сейчас оно практически вышло из употребления. Сама епанча как предмет одежды исчезла из быта ещё в XIX веке, но фамилия сохранила память о древнем ремесле.

Если ударение в фамилии падает на второй слог (Епани́шникова), то это соответствует литературной норме. В разговорной речи иногда смещают ударение на третий слог (Епанишни́кова), но это считается просторечным вариантом.