Фамилия Ескенова — женская форма, а мужская, Ескенов, образована по стандартной для тюркских языков модели: к основе добавляется русский патронимический суффикс -ов. Это типичная ситуация для фамилий народов Поволжья, Казахстана и Средней Азии, которые вошли в состав Российской империи и получили русские окончания.

Основа «Ескен» восходит к тюркскому мужскому имени Ескен (или Искен). Наиболее вероятное происхождение — от глагольной формы со значением «выросший», «возмужавший» (от тюрк. *es- / ös- — «расти»). В казахском и башкирском языках слово «ескен» может означать «взрослый», «зрелый», «достигший роста». Таким образом, имя давали мальчику с пожеланием крепкого здоровья и роста, либо как описательное прозвище для высокого или статного человека.

Встречается и менее распространённая версия: связь с арабским именем Искандер (Александр) через тюркскую огласовку. Но в этом случае форма обычно звучала бы как Искенов или Ескендеров. Поэтому версия с «выросшим» выглядит более прямой и органичной для тюркской антропонимии.

Географически фамилия Ескенов чаще всего встречается в Казахстане, а также у башкир и татар. В России носители сосредоточены в Оренбургской, Челябинской областях и в Башкортостане. Социальный состав предков — скорее всего, крестьяне-скотоводы или воины-казахи, поскольку в кочевой среде прозвища по физическим качествам были распространены шире, чем в оседлой земледельческой.

Интересная деталь: в некоторых говорах ударение в фамилии может падать на первый слог (Е́скенов), хотя нормативно — на второй (Еске́нов). Это указывает на живое бытование фамилии в устной речи, где она не застыла в письменной форме, а продолжает меняться по законам местного произношения.