Фамилия Евгенян образована от имени Евгений по типичной для армянской ономастики модели: основа + патронимический суффикс -ян (в старой орфографии -янц). Этот суффикс означает «из рода такого-то» или «сын такого-то», то есть Евгенян — «потомок Евгения». В отличие от русских фамилий на -ов/-ев или -ин, армянские фамилии не меняют форму по полу и склоняются только в мужском роде (у женщин остаются неизменяемыми).

Имя Евгений греческого происхождения (eugenes — «благородный», «хорошего рода»). В Армению оно попало через христианство вместе с греческой и сирийской культурой, но никогда не было исконно армянским. В армянской среде это имя встречалось реже, чем в русской, поэтому фамилия Евгенян — сравнительно редкая. Она не принадлежит к числу массовых армянских фамилий, таких как Петросян или Арутюнян, и, скорее всего, указывает на относительно позднее закрепление прозвища или имени за родом.

Географически фамилия Евгенян может быть связана с западными регионами исторической Армении (Западная Армения в составе Османской империи) или с армянской диаспорой, где имя Евгений было более употребительно под влиянием европейских или русских контактов. В современной Армении фамилия встречается редко, чаще — среди армян России, Грузии или стран Ближнего Востока.

Словообразовательная модель проста: корень Евген- (от имени Евгений, где конечное -ий отсечено) + суффикс -ян. В армянском языке нет уменьшительных суффиксов, как в русских фамилиях, поэтому Евгенян — прямое указание на родоначальника по имени. Если бы фамилия была русской, она звучала бы как Евгеньев или Евгеньин, но армянский суффикс меняет не только окончание, но и социальный контекст: такие фамилии указывают на кровное родство, а не на принадлежность к поместью или ремеслу.

Иногда фамилию путают с Евгеньян (с мягким знаком) — это орфографическая ошибка, возникшая под влиянием русского написания имени. В армянском языке мягкого знака нет, поэтому правильная форма — Евгенян, без смягчения.