Фамилия Фабко — украинская или южнорусская по происхождению, образованная по модели, типичной для западных и центральных областей Украины. Суффикс -ко (в безударной позиции часто переходит в -ка) указывает на уменьшительную или патронимическую форму: так в XVI–XVII веках называли сына, ученика или младшего родственника человека, чьё имя или прозвище легло в основу. В данном случае основа — Фаб-.

Самое вероятное объяснение: основа восходит к имени Фабий (лат. Fabius) или к его народной форме Фабей. Это римское родовое имя, которое через церковные святцы (святой Фабий, папа римский III века) попало в православный именослов, хотя встречалось редко. В украинской среде имя могли сократить до Фаба или Фабко, а от него уже образовать фамилию — буквально «потомок Фаба» или «маленький Фаб».

Менее вероятна, но возможна связь с польским словом fabka — «боб» (диалектное, от łac. faba). В этом случае прозвище Фабко мог получить человек, занимавшийся выращиванием или торговлей бобами, либо по внешнему сходству (круглолицый, полный). Однако для польских земель фамилия Фабко нехарактерна — там чаще встречается Фабка или Фабковский.

Географически фамилия Фабко распространена на западе Украины (Львовская, Тернопольская области) и в приграничных районах Беларуси. В России встречается редко, в основном среди потомков переселенцев конца XIX — начала XX века. Небольшой очаг есть в Краснодарском крае, куда украинские крестьяне массово переезжали в столыпинскую аграрную реформу.

Важная деталь: ударение в фамилии плавающее. В украинском произношении — Фабко́ (с ударением на последний слог, по аналогии с Шевченко, Симоненко). В русском языке часто смещается на первый слог — Фа́бко, под влиянием привычной акцентной модели для фамилий на -ко. Оба варианта допустимы, но исходная форма — с ударением на -ко.

Сословной привязки у фамилии нет: её носили и казаки, и крестьяне, и мещане. В реестрах Запорожского войска XVII века фамилия не зафиксирована, но в метрических книгах Подольской губернии XIX века Фабко встречается регулярно — в основном как фамилия сельских ремесленников и хлеборобов.