Фамилия Факова — женская форма фамилии Факов, и её происхождение совсем неочевидно. В русских фамилиях на -ов/-ев основа обычно восходит к имени, прозвищу или названию профессии. Здесь корень «фак-» сразу настораживает: он не характерен для славянских языков. Самая правдоподобная версия — связь с тюркским или арабским миром. В тюркских языках слово «фак» или «факъ» могло означать «щель», «отверстие», а в переносном смысле — «хитрец» или «ловкач». В арабском «фак» (فَق) переводится как «челюсть» или «скула» — такое прозвище могли дать человеку с крупными скулами или характерным прикусом.

Есть и другая, более прозаическая версия. В русских говорах слово «фак» иногда фиксировали как диалектное обозначение мешка или кулька — например, в сибирских областях. Тогда Факов — сын человека по прозвищу Фак, то есть «Мешок»: возможно, торговца или носильщика.

Суффикс -ов указывает на типичную русскую модель образования фамилии в XVI–XVII веках: отчество, закреплённое за потомками. Фамилия Факов (и Факова) редкая, её географическое ядро — южные регионы России, в частности Ростовская область и Краснодарский край. Встречается она и у адыгских народов, что дополнительно указывает на кавказско-тюркские корни.

Споров вокруг фамилии почти нет: гипотеза о связи с латинским «factum» (дело) или греческим «φάκα» (силок) слишком натянута, чтобы её всерьёз рассматривать. Так что, скорее всего, предки носителей фамилии Факова были либо людьми с заметной внешностью, либо практичными торговцами — в любом случае, прозвище у них было ярким и запоминающимся.