Основой фамилии Фантова послужило церковное имя Фантин или Нифонт. Имя Фант представляет собой просторечную форму имени Фантин, которое в переводе с латинского означает «ребенок» или «детский». В истории православия известны два святых покровителя этого имени: праведный Фантин чудотворец, день памяти которого приходится на 6 августа, и преподобный Фантин Солунский (12 сентября). В обиходе употреблялось несколько форм этого имени: Фантей, Фантик, Фантя, Фанта и Фант. Разговорная форма Фант могла быть также образована от имени Нифонт при его написании через «а» (то есть в форме Нифант) и усечении начального слога. Имя Нифонт имеет греческое происхождение и переводится как «трезвый, рассудительный». Таким образом, потомок человека, обладающего именем Фант, со временем получил фамилию Фантова.