Фамилия Фархатов образована от имени Фархат, диалектного варианта мужского древнеиранского имени Фархад, которое в переводе на русский язык означает «непобедимый», «способный, смышленый». Фамилия Фархатов довольно распространена на Кавказе. Таким образом, потомок человека, которого звали Фархат, со временем получил фамилию Фархатов.