Фамилия Фатькова — женская форма мужской фамилии Фатьков, и её происхождение напрямую связано с неканоническим личным именем или прозвищем Фатько. Чтобы понять, что это за основа, нужно заглянуть в народную ономастику, где корень «фат-» почти всегда указывает на тюркское или арабское влияние.

Самая вероятная версия — происхождение от имени Фаттах (араб. «победитель», «открывающий благо»), которое в русской среде могло сократиться до Фатька. В южнорусских и казачьих говорах, где активно смешивались славянские и тюркские элементы, такие усечения были обычным делом: Фаттах превращался в Фатьку, а от него уже образовывалась фамилия с типичным патронимическим суффиксом -ов. Суффикс -к- в основе здесь уменьшительно-пренебрежительный, как в Ивашка, Петька, что указывает на простонародное, а не боярское происхождение рода.

Вторая, менее распространённая гипотеза связывает фамилию с прозвищем Фатька от древнерусского «фать» — так в некоторых говорах называли хвастуна или щеголя. Но это объяснение слабее: слово «фать» в значении «хвастун» встречается редко и не имеет устойчивой диалектной базы, в отличие от тюркских имён, которые массово входили в русский быт после присоединения Казанского и Астраханского ханств.

Географически фамилия Фатькова тяготеет к Поволжью и Уралу — регионам, где веками жили рядом русские, татары и башкиры. Встречается она и на юге России, в Ростовской и Волгоградской областях, что также объясняется историческими контактами с тюркским населением. Сословно предки Фатьковых, скорее всего, были крестьянами или посадскими людьми — фамилия образована от просторечной формы имени, что исключает дворянское происхождение.

Ударение в фамилии традиционно падает на первый слог — Фа́тькова, хотя в некоторых семьях под влиянием украинского или южнорусского говора могут произносить с ударением на второй слог: Фатько́ва. Оба варианта допустимы, но первый считается литературной нормой.