Фамилия Фильчкова — женская форма, а её основа, мужская фамилия Фильчков, строится по простой и распространённой модели: суффикс -ов- присоединён к основе Фильчк-. Суффикс -ов- в русских фамилиях указывает на принадлежность («чей?»), то есть Фильчков — буквально «сын Фильчка» или «человек из семьи Фильчка». Сама основа Фильчк- — это уменьшительная форма от имени Филя, которое в свою очередь является народной, сокращённой версией крестильного имени Филипп (от греческого «любящий коней»). Таким образом, фамилия восходит к имени Филипп, но не напрямую, а через цепочку бытовых уменьшений: Филипп → Филя → Филька → Фильчко → Фильчков.

Интересно, что суффикс -к- в основе Фильчк- здесь не просто уменьшительный, а может указывать на конкретный диалектный или бытовой вариант имени. В некоторых русских говорах форма «Фильчко» или «Фильчка» бытовала как ласкательное или обиходное обращение к человеку по имени Филипп. В украинской и белорусской традиции суффикс -к- в фамилиях на -ко (типа Фильченко) более характерен, но в русском варианте Фильчков суффикс -ов- «обрусел» окончание, закрепив принадлежность к роду.

Поскольку фамилия образована от имени, а не от прозвища по ремеслу или внешности, её носители могли быть людьми любого сословия — от крестьян до мещан. Исторически фамилии на -ов/-ев в центральной России получили массовое распространение в XVI–XVII веках, и Фильчков мог появиться именно тогда. Стоит отметить, что фамилия редкая: её носители сосредоточены в основном в центральных и южных регионах России, а также на Украине, что подтверждает её происхождение от народной формы имени, бытовавшей в разных славянских диалектах.

Если сравнивать с однокоренными фамилиями, то Фильчков стоит в одном ряду с Фильченко (украинский вариант), Филькин, Фильков, Фильчаков. Отличие Фильчкова — в суффиксе -чк-, который делает основу более «детской» или уменьшительно-ласкательной, что может говорить о том, что прозвище Фильчко дали младшему члену семьи или человеку небольшого роста. Прямых указаний на известных исторических носителей фамилии нет, но её звучание и структура типичны для русских фамилий, образованных от канонических имён через живую народную речь.