Фамилия Филионова — женская форма фамилии Филионов, и её разбор стоит начать с неочевидного: это не опечатка и не вариант фамилии Филонов, а самостоятельное образование с другим суффиксальным оттенком. В основе лежит мужское имя Филион — редкая народная форма от канонического имени Филипп. В русской традиции имя Филипп, пришедшее из греческого («любящий коней»), дало множество производных: Филя, Филька, Филипка, а также Филион — с суффиксом -ион, который в крестьянской среде воспринимался как уменьшительно-ласкательный или просторечный. Такие формы часто возникали в говорах северных и центральных губерний, где имя Филипп произносили на местный лад, смягчая или укорачивая концовку.

Фамилия Филионов (а от неё Филионова) построена по стандартной патронимической модели: суффикс -ов присоединялся к основе имени, указывая на принадлежность — «сын Филиона». То есть предок носительницы этой фамилии, скорее всего, был крестьянином или посадским человеком, которого в обиходе звали не полным именем Филипп, а домашним Филион. В документах XVII–XVIII веков такие формы встречаются в переписных книгах, например, в Архангельской и Вологодской губерниях, где имя Филипп часто записывали как Филион или Филионка.

Важно различать фамилию Филионов и фамилию Филонов. Филонов происходит от имени Филон (греческое «любящий»), и это совсем другая основа. Филионов же — более редкий вариант, и его носители, вероятно, происходят из одной локальной группы, где имя Филион было распространено. Если искать географическую привязку, то по данным современных телефонных справочников и архивных записей, фамилия Филионов (и Филионова) чаще встречается на Русском Севере, в частности в Вологодской и Кировской областях, а также среди старообрядческих общин, где бытовали архаичные формы имён.

Таким образом, фамилия Филионова — это не случайное искажение, а свидетельство живой народной речи: предки этой семьи в обиходе называли отца или деда ласково Филионом, а не строгим церковным Филиппом. В суффиксе -ион сохранилась та самая разговорная теплота, которая в официальных метриках превратилась в фамилию.