Основой фамилии Филистьянов послужило церковное имя Филист. Фамилия Филистьянов ведет свое начало от редкого греческого имени Филист, которое переводится на русский язык как «листва». В основе данной фамилии лежит производная форма этого имени — Филистьян. После смерти Филист превратилась в миндальное дерево. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Филистьян, со временем получил фамилию Филистьянов.