Фамилия Фильцина — женская форма фамилии Фильцин, которая образована от мужского личного имени или прозвища Фильца. Основа здесь — краткая форма имени Филя, которое в свою очередь является уменьшительным от Филат, Филимон или Филипп. В русской традиции такие «усечённые» имена (Филя, Филька) давали в быту, а суффикс -ин указывал на принадлежность: «чей?» — «Фильцин», то есть сын или потомок Фильцы. Модель типична для восточнославянских фамилий, где -ин добавляется к основам на -а, -я.

Слово Фильца могло быть не только именем, но и прозвищем. В диалектах «филя» или «филька» иногда обозначали простака, недотёпу или, наоборот, хитрого человека — в зависимости от контекста. В северных и центральных говорах встречалось ироничное «филя» в значении «простофиля». Однако в основе фамилии скорее лежит именно разговорная форма канонического имени, а не прозвищный оттенок — такие фамилии часто фиксировались у крестьян и мещан, где имя Филя было распространено.

Интересная деталь: написание через «ц», а не через «ч» (Фильчина) указывает на твёрдое произношение в основе. В южнорусских и украинских говорах звук «ц» в подобных именах встречался чаще, чем в северных. Это может говорить о том, что предки носителей фамилии жили на территории, где аканье и цоканье были нормой, — например, в рязанских, тульских или курских землях. Фамилия недворянская, без суффикса -ский, что указывает на происхождение из крестьянской или посадской среды.

Встречаемость фамилии Фильцина невысока, она редкая. В дореволюционных переписях её можно найти в центральных губерниях России, а также среди старообрядцев, где имя Филат было особенно популярно. Сегодня фамилия сохраняется в основном в России и на Украине, но не образует заметных гнёзд.