Фамилия Фионкин — один из тех редких случаев, когда основа ясна, а происхождение удивляет. В её основе лежит имя Фионка — уменьшительная форма от Фиона. А вот тут и начинается главный поворот: Фиона — это не исконно русское имя, а женское имя ирландского происхождения (от кельтского fionn — «белая», «светлая»). В русской традиции оно встречалось крайне редко, чаще как монашеское или заимствованное через западные календари.

Как фамилия образовалась по простой и продуктивной модели: суффикс -ин указывает на принадлежность. Фионкин буквально значит «сын Фионки» или «человек из семьи Фионки». Если бы основа была мужской (Фионка как прозвище мужчины), фамилия всё равно сохранила бы ту же форму — суффикс -ин не различает пол исходного имени.

Мужское прозвище Фионка могло возникнуть и независимо от женского имени. В русских говорах слово «фион» или «фиона» изредка фиксировалось как прозвище для человека с очень светлыми волосами или бледной кожей — прямая отсылка к кельтскому значению «светлый». В этом случае Фионкин — потомок светловолосого или белокожего предка.

Географически фамилия тяготеет к центральным и северным областям России, но встречается настолько редко, что её носители — буквально единичные семьи. В дореволюционных переписях она почти не засветилась, что говорит о позднем оформлении: скорее всего, Фионкины получили фамилию уже после отмены крепостного права, когда крестьянам массово давали фамилии по именам или прозвищам глав семей.

Из-за редкости фамилия не обросла легендами о дворянском происхождении или известных деятелях. Её главная особенность — необычная основа, которая звучит скорее по-европейски, чем по-русски, хотя словообразовательный механизм чисто славянский.