Фамилия Фомушин восходит к известному мужскому имени Фома (в переводе с арамейского означает «близнец»), а точнее к его уменьшительной форме - Фомуша. Поэтому выражение «Фома неверующий» стало нарицательным для недоверчивого слушателя. В некоторых говорах Фомой, Фомушей называли простоватого, вялого человека. Фомкой, Фомушей также именовали плута, вора, мошенника. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Фомуша, со временем получил фамилию Фомушин.