Фамилия Формакидов напрямую связана с греческим словом φάρμακον (фармакон), которое имело двойственное значение — «лекарство» и «яд». Такая смысловая развилка и определила характер прозвища, от которого пошла фамилия. Человек по прозвищу Формакид, скорее всего, занимался врачеванием или же изготовлением и продажей снадобий — в те времена эти занятия не разделялись так строго, как сейчас, и грань между полезным зельем и отравой часто была делом рук одного мастера.

Образ фармакида уходит корнями в древнегреческую мифологию. Вспомним сказочные сады царя Колхиды Айета, где в окружении высоких стен росли целебные и ядовитые растения. Охраняли эти владения псы с горящими глазами, а приготовлением снадобий ведали фармакиды — волшебницы, посвящённые в тайны действия ядов и лекарств. Отсюда, кстати, и пошло название науки фармакологии. По преданиям, фармакиды не гнушались и промыслом ядов, используя такие растения, как мандрагора, белена и дурман. Так что прозвище Формакид могло указывать не только на ремесленника-аптекаря, но и на человека, сведущего в тайных знаниях, связанных с травами и их силой.

Сама фамилия образована по типичной для русской ономастики модели: к основе Формакид добавился патронимический суффикс -ов, который указывает на принадлежность к роду. То есть Формакидов — это «сын Формакида», потомок того самого человека, которого в своё время прозвали за его занятия или знания.

Стоит отметить, что в истории православия известен иеромонах Феоклит Фармакид, живший в XIX веке. Он принимал деятельное участие в устройстве управления Церковью Королевства Греческого и был известен либеральными взглядами, настаивая на приспособлении церковных начал к современным условиям жизни. Его фамилия — та же самая, лишь в греческом написании, что лишний раз подтверждает греческие корни этого именования и его связь с образованной средой своего времени.

В русском языке фамилия Формакидов — редкая и книжная по своему происхождению. Вряд ли она возникла в крестьянской среде: слишком специфична основа, отсылающая к античной культуре и науке. Скорее, её носители — потомки людей образованных, возможно, связанных с духовенством, медициной или учёным миром, где греческое наследие имело особый вес.