Фамилия Гамота — редкий случай, когда прозвище перешло в фамилию почти без изменений, без типичных фамильных суффиксов -ов, -ин или -ский. Она застыла в форме, в которой её дали первому носителю. Чтобы понять её значение, нужно разобрать саму основу — слово «гамота».

В русских говорах и в украинском языке «гамотой» называли шум, гам, крик, суету (сравните: «гам», «гомон»). Однако есть и другое, более конкретное значение: «гамота» — это «гамза», то есть мошна, кошель, денежная сумка. В переносном смысле так могли прозвать либо скупого человека, либо, наоборот, того, кто при деньгах, либо просто обладателя приметного кошеля. Второе значение — «обжора» или «неуклюжий, неповоротливый человек» (от диалектного «гамотный» — медлительный). Таким образом, прозвище Гамота могло относиться к человеку шумному, суетливому, либо к тому, кто носил заметный кошель, либо к медлителю.

Сама по себе модель фамилии без суффикса (чистая основа) — архаичная. Такие фамилии чаще встречались на западе и юге России, особенно в казачьей среде, а также в Белоруссии и на Украине, где прозвища нередко становились фамилиями без дополнительного оформления. В центральных и северных областях такую форму скорее дали бы дворовому человеку или крестьянину, которого записали «по прозвищу» напрямую.

Есть и маловероятная, но возможная версия: связь с греческим словом «гамота» (от «гамос» — брак). В таком случае прозвище мог получить незаконнорожденный ребёнок или человек, связанный со свадебными обрядами. Но эта гипотеза слабая — греческое влияние на русские прозвища было локальным и редким.

Фамилия Гамота не относится к числу дворянских или знатных. Её носители — скорее всего, потомки крестьян или посадских людей, получивших фамилию по уличному прозвищу. Встречается она в основном в западных областях России и в Белоруссии, что подтверждает её западнорусское или украинско-белорусское происхождение. Сегодня это редкая фамилия, сохранившая в себе живое простонародное слово.