Фамилия Гамзаева образована от имени Гамза — мужского личного имени, широко распространённого у народов Кавказа, в Поволжье и на Урале. Имя восходит к арабскому корню «хамза», означающему «острый», «жгучий». В мусульманской традиции это имя связано с одним из прозвищ пророка Мухаммада, что придавало ему особый вес. Фамилия строится по стандартной русской модели: к основе добавляется суффикс принадлежности -ев, указывающий на «сына» или «потомка» человека по имени Гамза.

Существует и менее вероятная версия, связывающая фамилию не с арабским, а со славянским корнем. Согласно этой гипотезе, в основе может лежать прозвище Гомзай, образованное от глагола «гомзать» — «шуметь», «суетиться». Так могли назвать беспокойного, непоседливого человека. Переход корневой «о» в «а» в фамилии Гамзаева объясняется влиянием акающего произношения, свойственного русскому литературному языку: в безударном положении «о» звучит как «а». Однако эта версия менее убедительна: имя Гамза на Кавказе настолько укоренено, что арабское происхождение фамилии для большинства её носителей остаётся основным.

Фамилия Гамзаева — пример того, как имя, пришедшее из арабского мира через тюркское или кавказское посредничество, органично вошло в русскую фамильную систему. Окончательно установить, когда и где именно возник конкретный род Гамзаевых, можно только в рамках генеалогического исследования, опирающегося на документы и историю семьи.