Фамилия Ганихина — женская форма фамилии Ганихин, и чтобы понять её происхождение, нужно разобрать мужской вариант. Словообразовательная модель здесь прозрачна: основа «Ганих-» плюс типичный русский патронимический суффикс «-ин», указывающий на принадлежность: «чей?» — Ганихин, то есть сын или потомок Ганихи.

Ключевой вопрос — что такое «Ганиха»? Это не каноническое имя, а скорее всего, производная форма от крестильного имени Ганна. Ганна — это народный, упрощённый вариант имени Анна (через чередование начальных гласных, характерное для разговорной речи: Анна — Ганна). В русских говорах и документах XVI–XVII веков форма «Ганна» была широко распространена. Соответственно, Ганиха — это женское прозвище или обиходное имя, образованное от Ганна с помощью суффикса «-иха». Суффикс «-иха» в русской ономастике многозначен: он мог обозначать жену человека по имени муж (например, «Петриха» — жена Петра) или же просто разговорную, иногда пренебрежительную или ласкательную форму женского имени. В случае с Ганихой, скорее всего, мы имеем дело именно с обиходной формой имени Ганна.

Таким образом, фамилия Ганихин (и Ганихина) — это типичный «матримониальный» или «женский» патроним. Предком носителей фамилии была некая женщина по имени Ганиха, то есть Ганна. Фамилии, образованные от женских имён, встречаются реже, чем от мужских, и часто указывают на особые обстоятельства: например, на внебрачное происхождение, когда ребёнка записывали по матери, или на вдовье положение матери, ставшей главой семьи. Впрочем, в северных и сибирских говорах, где суффикс «-иха» был особенно активен, фамилии на «-ихин» могли образовываться и от женских прозвищ без какого-либо негативного оттенка — просто как указание на хозяйку дома.

Географически фамилии с основой «Ганих-» тяготеют к регионам, где была сильна традиция «иха»-форм: это Северное Поволжье, Вятка, Урал, Сибирь. Встречается и другая, менее вероятная версия: что в основе лежит не имя, а прозвище Ганиха, связанное с глаголом «ганить» — в некоторых говорах означающим «хулить, осуждать, бранить». Но поскольку имя Ганна было очень распространено, а прозвище от глагола «ганить» — редкое и локальное, первая версия выглядит убедительнее. Фамилия Ганихина — живое свидетельство того, как в русской традиции имя женщины могло стать родовым именем для целой семьи.