Фамилия Ганиш звучит не по-русски, и это не случайно: её основа не славянская, а, скорее всего, тюркская или западнославянская. Разберёмся по порядку.

Самая вероятная версия — тюркское происхождение от личного имени Ганиш. В тюркских языках корень «ган» означает «хан», «владыка», а суффикс «-иш» придаёт имени уменьшительно-ласкательный или уважительный оттенок. Таким образом, Ганиш могло быть прозвищем или производной формой от имени Ганий (Гани) — «богатый», «владеющий». В этом случае фамилия указывает на предка-тюрка, возможно, татарина, башкира или казаха, который нёс это личное имя. Модель образования проста: русский суффикс -ев или -ов здесь не нужен, потому что фамилия застыла в форме чистого имени без патронимического окончания — такое встречается у фамилий, принесённых в русскую среду из неславянских культур.

Вторая версия — западнославянская, а точнее, польская или чешская. В польском языке слово «ganić» означает «хулить», «порицать», а «ganisz» — форма второго лица единственного числа настоящего времени: «ты хулишь». Фамилия Ганиш могла возникнуть как прозвище ворчливого, придирчивого человека. Однако в польской ономастике такие отглагольные фамилии на -isz обычно редки и чаще встречаются в виде Ганиш (Ganisz) как вариант от имени Ган (Jan). В Чехии и Словакии фамилия Gániš фиксируется, но тоже не массово.

Географически фамилия Ганиш в России редка и встречается в основном в Поволжье и на Урале — регионах, где исторически сильны тюркские влияния. Встречается она и в странах бывшей Югославии (сербская форма Ганиш, Ganiš), где может восходить к тому же тюркскому имени, принесённому османским периодом.

Суффикс -ш в русских фамилиях — нетипичное окончание для исконно славянских моделей, что сразу выдает иноязычный корень. Если бы фамилия была образована от русского прозвища, она бы получила суффикс -ов или -ин (Ганишев, Ганишин). Отсутствие этих суффиксов — главный ключ: Ганиш — это либо застывшее личное имя, либо прозвище, которое не переоформили под русские стандарты.

Таким образом, носитель фамилии Ганиш с высокой вероятностью имеет тюркские корни, и его предок носил имя Ганиш, означавшее что-то вроде «ханский», «богатый». Западнославянская версия с «хулителем» менее вероятна, но исключать её полностью нельзя, особенно если семейное предание указывает на Польшу или Чехию.