Фамилия Ганоченко — яркий пример украинской модели образования фамилий с помощью суффикса -енко. В XVI–XVII веках этот суффикс на землях современной Украины был главным указателем на родство: он означал «маленький» или «сын». Поэтому Ганоченко буквально расшифровывается как «сын Ганока» или «потомок Ганока».

Сам Ганок — это, скорее всего, производная форма от крестильного имени Гавриил. В переводе с древнееврейского это имя означает «божественный воин». В простонародной русской и украинской среде имя Гавриил часто сокращали до Гаврила, а затем и до коротких форм вроде Ганя. От этой уменьшительной формы и образовалось имя Ганок. Святым покровителем этого имени считается Архангел Гавриил — ангел, который, согласно Библии, принес Деве Марии благую весть о рождении Иисуса Христа.

Но есть и другая версия происхождения, которая уводит нас от церковных имен к бытовым прозвищам. В основе фамилии может лежать не имя, а прозвище Ганок. В украинском языке есть слово «ґанок» — это крыльцо. Если человек любил сидеть на крыльце, проводил там всё свободное время, соседи могли дать ему соответствующее прозвище. В белорусском языке «ганок» означает небольшой плот. В этом случае прозвище мог получить мастер по изготовлению плотов или перевозчик. Обе эти версии имеют право на существование, хотя версия с именем Гавриил встречается чаще и выглядит более естественной для фамилий этой модели.