Основой фамилии Ганьшин послужило мирское имя Ганьша. Фамилия Ганьшин была образована от имени Гавриил. В основе фамилии лежит его уменьшительная форма – Ганя, Ганьша. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Ганьша, со временем получил фамилию Ганьшин.