Фамилия Ганшу — редкая и неочевидная с точки зрения происхождения. Если отбросить версию случайного искажения при переписи, то наиболее вероятных путей два: немецкий и тюркский, причём первый выглядит убедительнее.

В немецком языке слово «Gans» (гусь) дало множество фамилий: Ганс, Ганзель, Гансман и другие. Форма «Ганшу» могла возникнуть из диалектного варианта «Ganschuh» или как русифицированное окончание немецкой фамилии Gansch (ср. фамилии типа Шмидт → Шмидту, Фишер → Фишеру — в некоторых регионах России так записывали немцев в документах, добавляя окончание -у по аналогии с русскими фамилиями на -ов). Такое явление встречается у поволжских немцев, где фамилии нередко обрусевали в окончаниях. Таким образом, предок-носитель фамилии мог быть немецким колонистом, переселившимся в Россию в XVIII–XIX веках, а его прозвище было связано либо с птицей (гусем), либо с профессией гусятника.

Вторая версия — тюркская. В казахском, башкирском и татарском языках слово «ганш» или «ханш» означает «ханша», «княжна» или «госпожа» (женская форма от «хан»). Однако фамилия Ганшу в таком случае образована не по обычной тюркской модели (обычно -ов/-ев, -ин), а сохранила почти неизменную основу, что нетипично. Возможно, это поздняя запись прозвища, данного женщине из знатного рода, но для фамилии, передаваемой по мужской линии, это маловероятно. Скорее всего, тюркский корень здесь случаен, а фамилия всё же немецкая.

Суффикс -у в конце фамилии — ключевая зацепка. В русской ономастике такое окончание характерно для украинских фамилий (Грицу, Петру) или для записанных на слух иноязычных фамилий с утраченным окончанием. В данном случае это, скорее всего, адаптация немецкой фамилии под русскую грамматику: окончание -у прибавляли к основе, чтобы её можно было склонять (Ганшу — Ганшу, Ганшу). Географически фамилия встречается в единичных случаях на юге России и в Поволжье, что косвенно подтверждает связь с немецкими колониями.

Социальный контекст: если фамилия немецкая, предки могли быть крестьянами-колонистами, ремесленниками или мещанами. Если тюркская — то, скорее, из среды кочевой знати, но это менее вероятно. Точных данных о сословной принадлежности носителей фамилии Ганшу в открытых источниках нет — фамилия слишком редкая.