Вероятно, фамилия Ганту образована от имени Ганту (Hanttu), которое является финским и эстонским аналогом имени Ганс. Оно же представляет собой краткую форму имени Иоганн, распространенного в Дании, Германии и Норвегии. Имя Иоганн, в свою очередь, является западноевропейским вариантом древнееврейского имени Johanann (Йоханаан), имеющего значение «милость Божия» (русские эквиваленты имени — Иван, Иоанн). Это имя было широко распространено в христианской традиции. Так, в Книге памяти «Хранить вечно» упоминается Ганту Давид Федорович, который родился в 1908 году.