Фамилия Ганюшев — нечастая, но её происхождение укладывается в хорошо известную модель русских фамилий на -ев. Основа здесь — Ганюш, а это одна из народных форм крестильного имени Ганна (от Иоанн, церковнославянское Иоанн — «милость Божия»). В русских говорах Иван превращался в Гана, Ганю, Ганюшу — так же, как, скажем, Гаврила давал Гаврюшу. Суффикс -ев указывает на притяжательное значение: «сын Ганюша» или «человек из семьи Ганюшей». Фамилия образована не от полного имени, а от уменьшительно-ласкательной формы, что типично для крестьянской и мещанской среды XVIII–XIX веков: в документах чаще фиксировали не Ивана, а его домашнее прозвище.

Интересная особенность — редкий для русских фамилий суффикс -юш- в основе. Он характерен для северо-западных и северных говоров (новгородские, вологодские, архангельские земли), где «Ганюша» звучало естественнее, чем в южных диалектах. Если сравнивать с однокоренными фамилиями — Ганин, Ганов, Ганюшкин, — то Ганюшев стоит особняком: в ней сохранилась форма с мягким окончанием, которая могла указывать на конкретную местную традицию произношения. Встречается фамилия и в белорусском варианте (Ганюшаў), что не исключает миграции носителей.

Прямых документальных свидетельств о сословной принадлежности Ганюшевых нет, но модель образования и распространённость в сельских метрических книгах XIX века (по данным переписей, единичные записи в Вологодской и Костромской губерниях) указывают на крестьянское или однодворческое происхождение. Дворянских родов с такой фамилией в родословных книгах не зафиксировано.

Известные носители в истории — единичны, и то в основном местного значения: например, в списках участников Первой мировой войны упоминается рядовой Ганюшев из Вятской губернии. В советское время фамилия не получила широкой известности, но сохранилась в рассеянном виде — от Архангельска до Сибири. Сегодня Ганюшевы встречаются редко, и для её носителя фамилия — скорее маркер северорусских корней, чем указание на конкретное занятие предков.