Фамилия Ганюшева — женская форма фамилии Ганюшев, а та, в свою очередь, образована от мужского имени или прозвища Ганюш. Это уменьшительно-ласкательный вариант от канонического имени Ганна, которое является просторечной формой христианского имени Иоанн (в русской традиции — Иван). Таким образом, этимологически Ганюшев родственник Иванову, но с иной, более редкой суффиксальной огласовкой. Если Ивановых в России миллионы, то Ганюшевы — фамилия локальная и немногочисленная.

Ключевая особенность — суффикс -юш-. В русской антропонимии такие формы (Ганюш, Ванюш, Манюш) характерны для северных и северо-западных говоров, а также для украинского и белорусского влияния. Имя Ганюш могло закрепиться как прозвище за человеком, которого в быту звали именно так, а не стандартным Ваней или Иваном. Фамилия застыла в притяжательной форме: «чей сын?» — Ганюшев, то есть потомок Ганюша.

Географически фамилия тяготеет к регионам, где исторически смешивались великорусские и белорусские диалекты — прежде всего к Смоленщине, Брянщине, Псковской области. Встречается она и в среде староверов, которые нередко сохраняли архаичные имена и прозвища, вышедшие из обихода в центральной России. В дореволюционных переписях Ганюшевы фиксировались в основном среди крестьян и мещан, но точного сословного распределения по фамилии нет — слишком мала выборка.

С точки зрения словообразовательной модели, Ганюшев стоит в одном ряду с фамилиями Ванюшев, Манюшев, Данюшев. Все они образованы по одному принципу: основа — разговорное имя на -юш, суффикс -ев (фонетический вариант -ов после мягкого согласного). Ударение в фамилии, скорее всего, падает на второй слог: Ганю́шева, хотя в разных семьях возможны варианты, так как исходное имя Ганю́ш произносили с ударением на «ю».

Итог: фамилия Ганюшева — не простая, а с характерным диалектным оттенком. Она прямо указывает на то, что предка звали Ганюш (ласкательное от Иван), и, вероятно, семья жила на стыке русских и белорусских земель. Никакой другой, более древней или иноязычной версии происхождения у неё нет.