Фамилия Гарафутдинова ведет свое начало от арабского мужского имени Гарафутдин. В переводе на русский язык оно означает "вестник религии"; "знаток религии"; "умеющий разъяснить каноны религии". Вероятно, нарекая ребенка именем Гарафутдин, родители желали своему сыну стать достойным мусульманином. Процесс формирования фамилий был достаточно длительным, поэтому окончательно говорить о точном месте и времени возникновения рода Гарафутдиновых можно лишь на основании генеалогических исследований.